在微生物研究領域，菌落計數與篩選是兩項基礎且關鍵的技術。菌落計數是量化樣本中微生物數量的核心方法，通過培養微生物形成可見菌落，基于菌落數量推算原始樣本中的微生物濃度（如CFU/mL，菌落形成單位/毫升）。而菌落篩選旨在從復雜菌群中分離、鑒定目標菌株。

菌落計數統計定量方法因為它的準確性、靈敏性、簡便經濟和可產生純培養等優點而自19世紀末Koch和Petri先后發明固體培養基和雙層培養皿后沿用至今。

目前，大多數實驗室仍采用傳統的計數方法，雖然成本低廉，但存在著諸多缺陷。

通過高分辨率相機拍攝菌落圖像，利用專業的軟件進行圖像分析和處理，實現菌落的自動識別、計數、分類篩選以及形態分析等功能，顯著提升實驗效率與標準化水平。